1.廢氣處理

　　產生少量有毒氣體的環境監測試驗應在實驗室通風柜內進行，并通過通風機等排氣設備向外界排放。產生大量有毒氣體的實驗在排放前必須加以吸收或處理。如SO2、NO2、H2S等酸性氣體可通過管道泵送至堿性溶液中，實現酸堿中和排放。燃燒后排放高濃度可燃氣體。

　　2.廢液處理

　　儲存在人體內的含重金屬、致畸、致癌的廢液應倒入專用廢液桶集中處理后排放。高濃度的酸堿廢液應單獨倒入專用的酸堿廢液桶中，用大量水中和稀釋后排放。含有高濃度有機物的廢液應裝入專用儲槽，集中存放，按規定儲存足夠量的焚燒。其他一般廢液，排放后可用大量水稀釋。

　　3.固體廢物處理

　　實驗室產生的一般固體廢物(如木屑、紙屑、碎玻璃、廢塑料等)與生活垃圾性質相同，可直接倒入實驗室垃圾桶，與生活垃圾交由城市環衛部門處理。廢液處理和有毒有害固體廢物產生的沉淀，由專人負責收集和妥善處理。危險廢物處理公司按照危險物品進行安全處置或者社會化處理的，應當統一收集集中處理。

　　對不含氯的固體廢物應單獨收集，并在一定條件下進行消毒處理。目前，實驗室環境污染問題還沒有得到足夠的重視，污染控制工作沒有得到有效開展。雖然有些實驗室按要求配備了殘余液體儲存罐，但實際上根本不存在，而且往往是一次到達。

　　而如何處理儲罐裝滿后的殘余液體也是一個棘手的問題。最后，在評價環境監測站標準化建設和計量過程中，大多對監測能力和質量管理進行評價，很少要求實驗室存在環保問題，且缺乏必要的監督，環境監測實驗室在環境管理方面存在薄弱環節，實驗室造成的外部環境污染。